אפרת קליפשטיין סיימה לימודי תואר ראשון בפסיכולוגיה וגיאוגרפיה באוניברסיטת בן גוריון ולימודי תואר שני בעיצוב תעשייתי בטכניון ולמדה אמנות במדרשה לאמנות בבית ברל. הציגה במוזיאונים שונים. ביניהם; מוזיאון תל אביב, מוזיאון ישראל, המשכן לאמנות עין חרוד, מוזיאון הרצליה, מוזיאון פתח תקווה ובגלריות בארץ ובחו"ל. עבודותיה נמצאות באוספים פרטיים ומוזיאולים. קליפשטיין זכתה בפרסים שונים והשתתפה בתוכניות שהות באוהיו, ניו יורק ובספרד.
בארבע השנים האחרונות אפרת קליפשטיין מנהלת את תכנית הלימודים ב'בסיס לאמנות ותרבות'.